Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lef1P27782 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms