Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgrf1P27671 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rasgrf1P27671 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rasgrf1P27671 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms