Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfraP26618 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfraP26618 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms