Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd11P23813 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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