Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tsta3P23591 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tsta3P23591 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsta3P23591 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsta3P23591 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tsta3P23591 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tsta3P23591 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tsta3P23591 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tsta3P23591 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsta3P23591 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms