Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou3f1P21952 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou3f1P21952 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms