Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a2P20490 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a2P20490 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms