Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrkcaP20444 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcaP20444 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcaP20444 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms