Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cox5bP19536 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cox5bP19536 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms