Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csn1s1P19228 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csn1s1P19228 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms