Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdc1P18828 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms