Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Selenbp1P17563 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms