Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkceP16054 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkceP16054 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkceP16054 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.2 ms