Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChgbP16014 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgbP16014 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgbP16014 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms