Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme1P15532 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme1P15532 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme1P15532 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms