Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd1P13516 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd1P13516 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms