Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnni2P13412 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnni2P13412 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnni2P13412 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms