Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sub1P11031 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sub1P11031 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sub1P11031 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms