Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myod1P10085 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms