Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igsf6P0C6B7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igsf6P0C6B7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms