Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa9P09631 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa9P09631 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms