Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna9P09235 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifna9P09235 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifna9P09235 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms