Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb1P09055 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb1P09055 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb1P09055 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb1P09055 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgb1P09055 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms