Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtrP07309 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtrP07309 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TtrP07309 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TtrP07309 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtrP07309 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TtrP07309 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtrP07309 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtrP07309 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtrP07309 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtrP07309 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtrP07309 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtrP07309 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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