Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoa4P06728 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoa4P06728 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms