Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04214 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04214 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04214 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
P04214 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04214 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04214 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P04214 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04214 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04214 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P04214 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04214 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04214 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04214 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04214 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04214 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04214 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04214 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P04214 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
P04214 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P04214 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P04214 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P04214 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P04214 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04214 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04214 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms