Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GzmbP04187 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GzmbP04187 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GzmbP04187 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms