Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01822 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01822 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01822 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01822 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01822 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01822 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01822 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01822 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01822 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01822 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01822 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01822 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01822 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01822 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01822 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01822 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01822 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01822 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms