Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01747 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01747 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01747 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01747 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01747 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01747 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01747 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01747 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01747 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01747 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01747 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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