Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01658 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01658 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01658 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01658 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01658 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01658 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01658 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01658 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01658 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01658 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01658 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01658 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01658 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01658 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01658 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01658 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01658 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms