Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odc1P00860 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odc1P00860 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odc1P00860 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odc1P00860 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odc1P00860 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odc1P00860 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odc1P00860 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms