Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vti1aO89116 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1aO89116 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1aO89116 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms