Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcnkO88874 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcnkO88874 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcnkO88874 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcnkO88874 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcnkO88874 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CcnkO88874 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CcnkO88874 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms