Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops6O88545 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cops6O88545 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cops6O88545 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms