Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl22O88430 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl22O88430 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms