Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnnal1O88327 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnnal1O88327 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnnal1O88327 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms