Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd2O70572 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd2O70572 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd2O70572 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd2O70572 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd2O70572 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd2O70572 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smpd2O70572 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms