Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmx1O70218 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmx1O70218 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmx1O70218 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms