Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atf5O70191 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf5O70191 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atf5O70191 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf5O70191 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atf5O70191 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atf5O70191 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms