Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sigmar1O55242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sigmar1O55242 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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