Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Supt5hO55201 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt5hO55201 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Supt5hO55201 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt5hO55201 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms