Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2a2O55143 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp2a2O55143 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms