Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg2O55111 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dsg2O55111 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms