Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copb2O55029 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb2O55029 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb2O55029 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms