Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a2O54833 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms