Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmbrO54799 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NmbrO54799 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms