Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp15O54732 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp15O54732 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp15O54732 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms