Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTIFO43310 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTIFO43310 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTIFO43310 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTIFO43310 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTIFO43310 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTIFO43310 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTIFO43310 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTIFO43310 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTIFO43310 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTIFO43310 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTIFO43310 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTIFO43310 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTIFO43310 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTIFO43310 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTIFO43310 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTIFO43310 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTIFO43310 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTIFO43310 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTIFO43310 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTIFO43310 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTIFO43310 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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