Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CrcpO35427 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrcpO35427 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CrcpO35427 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CrcpO35427 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CrcpO35427 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrcpO35427 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms