Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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H2-Q1O19441 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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H2-Q1O19441 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Q1O19441 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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H2-Q1O19441 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-Q1O19441 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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H2-Q1O19441 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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H2-Q1O19441 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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H2-Q1O19441 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Q1O19441 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms